Debuggin' Everyday

Vienna

きれいな町なのに、ざんねん。 Rainer さんの紹介で、使ってないアパートをお借りしました。

天気悪かったですよ。
あんまり滞在時間も長くなかったし。きれいな町なのに、ざんねん。

Rainer さんの紹介で、使ってないアパートをお借りしました。

門を入ると中庭があるんですよ。いい感じだー。

部屋の中の写真は… 撮り忘れ。
お昼ご飯↓　多すぎですから！

Hackathon で泥沼 (泥縄かも?)
swig-1.3.29
% ./configure ; make
xerces-c 2.7.0 (/usr/local 用ではない)
% cd xerces-c-src_2_7_0
% setenv XERCESCROOT ${PWD}
% cd src/xercesc
% vi Makefile.incl
– LD_SONAME = -install_name ${PREFIX}/lib/${SO_NAME}
– LD_SODEPDOM = -install_name ${PREFIX}/lib/${SO_DEPDOM}
+ LD_SONAME = -install_name ${SO_NAME}
+ LD_SODEPDOM = -install_name ${SO_DEPDOM}
% ./runConfigure -pmacosx -nnative
% make
libsbml-2.3.4
./configure –with-xerces=`pwd`../xerces-c-src_2_7_0 –with-java=/usr –enable-layout –with-swig
make
こけました。swig が新しいとダメみたいです。1.3.25 あたりがよさそう。

Narita – Frankfurt

はじめて全日空の国際線で遠くにいきました。… ごはんがおいしい…これが夕食でした。

家を出るときは、まだ駅のホームに桜が。去年も同じ時期に国際会議にいってしまって、桜が見られなかったんですが、今年はみられた。

はじめて全日空の国際線で遠くにいきました。上海-東京は乗ったことがあったけれど。ごはんがおいしい…

フランクフルト空港の国内線ターミナルではレストランとかが見あたらず、これが夕食でした… ちょっと残念。

夕暮れのフランクフルト空港。

@ Czech

そういうわけでチェコにいます。写真とかはそのうち…とりあえず寝たい。

そういうわけでチェコにいます。
写真とかはそのうち…
とりあえず寝たい。

さいきんの自転車

ブレーキの引きが重いとか、変速の調子がついに悪くなったとか、つまり、ワイヤ周りだ。… たまにはちゃんとメンテナンスしてやらないとね。

しばらく放っておいたら最近具合が悪い。
ブレーキの引きが重いとか、変速の調子がついに悪くなったとか、つまり、ワイヤ周りだ。
日本に帰ったらワイヤ全交換だな。たまにはちゃんとメンテナンスしてやらないとね。
手持ちの Fuji の Cr-Mo フレームで、超高速通勤仕様の自転車を組もうと計画中。10s の 11-21 あたりだ。52×11 とかガンガン踏めるようになりたいです!?

libsbml + layout extension

SBMLReader reader = new SBMLReader(); SBMLDocument document = reader.readSBMLFromString(sbml); Model model = document.getModel(); Layout layout = model.createLayout(); で、 layout.delete(); とか書いてみたのだが、全然消えない… (これって、constructor とか destructor とかよくわかってない証拠な気がします。

libSBML を使って、こんな感じ↓に作ったレイアウト情報を削除したいと思った。

SBMLReader reader = new SBMLReader();
SBMLDocument document = reader.readSBMLFromString(sbml);
Model model = document.getModel();
Layout layout = model.createLayout();

で、

layout.delete();

とか書いてみたのだが、全然消えない… (ただの finalizer だからだ…) 結論としては、

ListOf listOfLayouts = model.getListOfLayouts();
long numLayouts = listOfLayouts.getNumItems();
for ( long i = numLayouts-1; i >= 0; i-- )  listOfLayouts.remove(i);

みたいにすればよいのですな。ふつうに libSBML を使って、species とか reaction とかを消す場合もこんな感じにやればいいみたいです。ていうか、サンプルのコードには、SBML のいろんな element を追加していって作る奴はあるんですが、消す奴はない (と思う) んですな…

そゆわけで、成田-フランクフルト線でひとつめのバッテリを消化して、無事に作業が終了したのでした。うひょー。

DVD 届いたので観てしまった。
凄かった。
海外のメジャーなレースの DVD なんかよりずっと生々しくて、とてもよい。
まじでおすすめ。

Vienna

きょうのコンパイル

Narita – Frankfurt

@ Czech

さいきんの自転車

libsbml + layout extension

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Goin’ to Czech

きょうの自転車

Japan Cup ’05 DVD