投稿者: yasu

なんか、デジタルカメラがファイルにつける番号が前のカメラと重複したらしく、一部の blog entry で画像が差し変わっていたので、修復しましたです。
過去3年分くらいのアーカイブを斜め読みした。あんまり面白くないな (笑)

今日は東大で、ライフサイエンス統合データベースプロジェクトのシンポジウム。

電源が使えなかったので、メモは最後のパネルだけ。
中村先生 (阪大): 化学のデータベースは、人手が入って整備されたものを購入する、というビジネスモデルがあったから続いてきた。ライフサイエンスのデータベースを public domain で (税金で) やる、とした場合の永続的な資金調達、ビジネスモデルは成り立つのか？
大久保先生 (遺伝研): この何年かでアメリカのベンチャーが明らかにしたのは、お金をかけて収集した大量のデータを限られた (頭のいい) 人たちが抱えてもコストを回収できるだけのリターンが得られない、ということ。だから、それを世界中で共有すればいい、というのがこれからの何十年かになるんではないか。
菱山先生 (文科省): 研究のお金の大半が税金から出ている以上、データは抱え込まずに公開しよう、というのは普通。だけど実際のところ、役所が強制的に公開させたりすればいいデータが出てくるのか、というとそれは別の問題。研究者の間でルールを作るのか、役所主導でやるのか、とか、みんなで考えないといけない。
中村先生: たとえば、政府からもらった grant の 1%は間接費として統合 DB のために使います、みたいなビジネスモデルも考えられる。
堀田先生: 統合データベースにデータを入れることで最終的にはデータを入れた人のメリットになる、というところにたどりつくのが目標。
ポスター発表のメモ:
– アミノ酸で全ゲノム比較がしたい (植物とか…)
– 脊椎動物とかの遺伝子予測に比較ゲノムは使えそうだなあ (これは、いますぐ僕らが何かやる、っていうことにはならないけどね)
使ってみようかな、という人はたくさん。

久々にチャリ出勤。でも、もう梅雨入りなのよねえ。
家から職場まで、電車を使うと1時間ちょっとかかるのだが、自転車なら35分であり、混雑にもまれることもないので、非常に快適。しかし何で最近さぼっていたかというと、天気が悪かったり体調が悪かったり、ということで。
帰りは、調布飛行場の近くでホタルを見てきた。夜10時半くらいだったので遅すぎたのか、あまり数はいなかったけど、飛んでるのも見られたよ。
23.22km @ 24.6km/h = 56m32s (odo 6289.1km)

The speed, size and dependability of programming languages, an experiment of 1368 programs, consisting of 19 benchmark reimplemented across 72 programming languages.
Awesome!

3ヶ月近くかかって、ようやく読み終えた。長かった。
ちょうど、いま僕が関わっているゲノムの解読プロジェクトも終盤戦にかかっているところで、この本の著者の言葉を借りれば、「神様がこの生物のゲノムを書いて以来、まだ誰も読んだことのない」ファイルが、僕の MacBook のハードディスクに入っている、という状況。配列の解析、というのは、想像以上に時間と体力のかかる仕事だと実感しているけれど、非常に愉快だ。
最後の方から二箇所、引用することにしよう。
Science is the only legitimate way to investigate the natural world. Whether probing the structure of the atom, the nature of the cosmos, or the DNA sequence of the human genome, the scientific method is the only reliable way to seek out the truth of natural events. Yes, experiments can be misguided, and science can make mistakes. But the nature of science is self-correcting. No major fallacy can long persist in the face of a progressive increase in Knowledge.
Nevertheless, science alone is not enough to answer all the important questions. Even Albert Einstein saw the poverty of a purely naturalistic worldview. Choosing his words carefully, he wrote, “Science without religion is lame, religion without science is blind.”

科学は自然界について調べるための、唯一適切な方法である。原子の構造や、宇宙の成り立ちや、ヒトのゲノム配列といったもののどれを調べるにしても、自然界のできごとに関する真理を探るためには科学が唯一の信頼できる方法である。もちろん実験は間違うことがあるし、科学も間違いを犯すことがある。しかし、科学はそれ自身を修正することができ、連続した知識の集積によって、大きな間違いが長い間にわたって残ることはありえない。
それでも、科学だけではすべての重要な問題に答えるには不十分である。アインシュタインでさえも、純粋に自然主義的な世界観の貧困さに直面している。彼の言葉を注意深く選べば、彼は「信仰のない科学は不完全であり、科学のない信仰は盲目である」と書いている。

それからもうひとつ、違うところから。
In that context, science can be a form of worship. Indeed, believers should seek to be in the forefront among those chasing after new knowledge. Believers have led science at many times in the past. Yet all too often today, scientists are uneasy about admitting their spiritual views. To add to the problem, church leaders often seem to be out of step with new scientific findings, and run the risk of attacking scientific perspectives without fully understanding the facts. The consequence can bring ridicule on the church, driving sincere seekers away from God instead of into His arms. Proverbs 19:2 warns against this kind of well-intentioned but misinformed religious fervor: “It is not good to have zeal without knowledge.”

そういう意味では、科学は神をあがめることのひとつの形になりうるのである。はっきり言えば、信仰を持つ者こそが、新しい知識を求める者たちの間で先頭に立とうとしなければならない。過去には何度も、神を信じる者たちが科学を牽引してきた。しかし今日においても、科学者たちにとって自分の信仰を言い表すことは容易ではない。さらに問題を難しくしているのは、教会の指導者たちが新しい科学的な知見から取り残され、それゆえに充分に事実を理解することのないまま科学的な見方を攻撃することがしばしば起きる、ということである。結果として教会に対する嘲笑を呼び、誠実に神を求める人たちを神に近づけるどころか遠ざけてしまうことになるのである。箴言19編2節はこのような、善意ではあるが間違った情報に基づく宗教的情熱に対して「知識のないまま熱意を持つのはよくない (英文から直訳)」と警告している。

「キリスト者だから」○○はしない、とか、信じない、というのは簡単で、信仰的な選択に見えることも多いけど、僕は思考停止というのは決して正しくない選択である、と思う。信仰というのは、神様との交わりの中で、聖書によって日々新たにされる (改革派教会的な言い方でいえば、まさに、「改革され続ける」) ものでなければならないはずだからだ。科学的な発見や知見に関して思考停止に至る、というのは、いわゆる「証にならない」行動であって、何事においてもキリスト者として真実を求め続ける姿勢を貫く、というのが重要ではないだろうか。
他にもいろいろ書きたいと思うことはあるが、ちゃんとまとめないとよくないと思うので、それはまたの機会に。

ここ数週間やたらと忙しくて、全然 blog とか書いてないわけですが、
一応生きてます。
どれくらい忙しいかというと、核実験とかミサイル発射とか、
全然しらなかった、というくらい。
毎日授業以外は研究室にこもってます。
これあと一ヶ月続いたら、倒れるなあ。
まあ、たまには逃げ出して、コンサート行ったりしており、
精神状態はそれほど悪くないですが。

大げさなタイトルですが (笑)
パンデイロ という、タンバリンみたいな楽器が猛烈にほしい。
これ、昔、しばじゅん ライブにいったときに、パーカッションの人が持ってて、すごかった (「しばじゅん、はじめました！」の DVD に入ってる)。
で、今日、野口茜さん というピアニストの方のライブを聴く機会があったのだけれど、そのトリオの打楽器の方が、これ持ってて、目の前で叩くのをじっくり見せていただいた。すげーよー。
うおー。
難しそうだけどね。

だいぶ読み進んだ。
p.206:
Creation is not an event that happened in 4004 BC; it is a process that began some 10 billion years ago and is still underway… Does the evolutionary doctrine clash with religious faith? It does not. It is a blunder to mistake the Holy Scriptures for elementary textbooks of astronomy, geology, biology, and anthropology. Only if symbols are construed to mean what they are not intended to mean can there arise imaginary, insoluble conflicts.

創造、というのは紀元前 4004 年に起きたできごとではなく、数百億年前にはじまって現在も続いているプロセスである。進化論は信仰と対立するものだろうか？そうではない。聖書を天文学、地質学、生物学、人類学の入門テキストと捉えることは大きな間違いである。シンボルが本来意図されたのと違う意味で解釈されるならば、架空の (本来存在しない) そして解決することのできない問題が発生する。

p.210:
I do not believe that the God who created all the universe, and who communes with His people through prayer and spiritual insight, would expect us to deny the obvious truths of the natural world that science has revealed to us, in order to prove our love for Him.

宇宙のすべてを創造し、祈りと霊的な働きにおいて人々と交わりをもたれる神が、私たちに対して科学が明らかにしたこの自然界の真理を否定するという形で神への愛を示すことを望まれる、などということは私は信じない。

なるほど。
聖書の無謬性を支持する、ということと、科学の入門テキストとして捉えない、ということは対立することではない、と思う。たぶん。