SBML Forum (Oct.12) @ Odaiba

大遅刻。
着いたら Narrator の説明やってたが、途中からでよくわからず。
Copasi の新しい paper が bioinformatics に載ったそうだ。
Layout Extension のやつも (Ralph Gauges が first author)
BioPAX: biological pathway exchange.
WOL (Web Ontology Language だっけ?) がベース。
220 も pathway database がある!! ので、共通のフォーマットを作りたいわけ。
PPI とか、そういうのはどうやって SBML に変換するかね？
SBML が well-defined なモデルの記述なのに対して、BioPAX は知識の記述な感じですな。