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/usr/local/X11R6/lib/libGL.so:
libc_r.so.5 => /usr/lib/libc_r.so.5 (0x281cf000)
libXxf86vm.so.1 => /usr/local/X11R6/lib/libXxf86vm.so.1 (0x281f0000)
libXext.so.6 => /usr/local/X11R6/lib/libXext.so.6 (0x281f5000)
libX11.so.6 => /usr/local/X11R6/lib/libX11.so.6 (0x28202000)
libc.so.5 => /lib/libc.so.5 (0x28082000)

--disable-gl しないと、普通に作った XFree86 がこんなふうになっているので、
libpthread と libc_r をいっしょにリンクして、えらいことになります。

Fatal error 'Spinlock called when not threaded.' at line 83 in file /usr/src/lib/libpthread/thread/thr_spinlock.c (errno = 0)

X 作りなおさなきゃね。